Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GCSAMQ8N6F7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms