Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC96Q2M329 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms