Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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