Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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