Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HNF4GQ14541 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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