Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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RPA4Q13156 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RPA4Q13156 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RPA4Q13156 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RPA4Q13156 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RPA4Q13156 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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