Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP4Q13115 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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