Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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