Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms