Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IRF8Q02556 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IRF8Q02556 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms