Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3F3AP84243 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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H3F3AP84243 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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H3F3AP84243 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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H3F3AP84243 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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H3F3AP84243 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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H3F3AP84243 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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H3F3AP84243 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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H3F3AP84243 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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H3F3AP84243 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H3F3AP84243 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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