Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COG7P83436 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COG7P83436 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COG7P83436 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COG7P83436 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COG7P83436 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COG7P83436 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COG7P83436 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COG7P83436 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COG7P83436 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms