Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB4BP68371 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms