Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms