Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJA8P48165 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GJA8P48165 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJA8P48165 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA8P48165 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms