Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJC1P36383 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJC1P36383 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms