Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms