Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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