Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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NFKB1P19838 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NFKB1P19838 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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