Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IFITM1P13164 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms