Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 AL049829.3-201ENST00000604456 1875 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 LINC02069-201ENST00000457449 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
A4D1N5 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 POLR3F-201ENST00000377603 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 ATP11AUN-201ENST00000623100 2241 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
A4D1N5 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms