Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4M8

LINC00588, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00588, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00588Q9Y4M8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00588Q9Y4M8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms