Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms