Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms