Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms