Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGR6Q9HBX8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGR6Q9HBX8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGR6Q9HBX8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LGR6Q9HBX8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LGR6Q9HBX8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LGR6Q9HBX8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LGR6Q9HBX8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LGR6Q9HBX8 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LGR6Q9HBX8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGR6Q9HBX8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms