Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms