Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELL2Q99435 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NELL2Q99435 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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