Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGLYRP2Q96PD5 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms