Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CABS1Q96KC9 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms