Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L3BQ96GX2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms