Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms