Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUPD1Q68J44 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms