Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FHOD3Q2V2M9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms