Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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RRN3P1Q2M238 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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RRN3P1Q2M238 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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RRN3P1Q2M238 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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RRN3P1Q2M238 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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RRN3P1Q2M238 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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RRN3P1Q2M238 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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RRN3P1Q2M238 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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