Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms