Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTTNQ14247 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms