Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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TCIRG1Q13488 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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TCIRG1Q13488 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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TCIRG1Q13488 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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TCIRG1Q13488 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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TCIRG1Q13488 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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TCIRG1Q13488 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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TCIRG1Q13488 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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