Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms