Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms