Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRGP23470 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRGP23470 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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