Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYT1P21579 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYT1P21579 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYT1P21579 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYT1P21579 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYT1P21579 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYT1P21579 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SYT1P21579 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYT1P21579 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms