Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRF1P14222 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRF1P14222 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PRF1P14222 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRF1P14222 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRF1P14222 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRF1P14222 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRF1P14222 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRF1P14222 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRF1P14222 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRF1P14222 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PRF1P14222 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRF1P14222 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRF1P14222 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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