Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms