Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOA4P06727 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APOA4P06727 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOA4P06727 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOA4P06727 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APOA4P06727 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.05■□□□□ 0
APOA4P06727 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOA4P06727 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APOA4P06727 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOA4P06727 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOA4P06727 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOA4P06727 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms