Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms