Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC1O14908 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms