Protein–RNA interactions for Protein: E2RYF7

HCG22, Protein PBMUCL2, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG22E2RYF7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
HCG22E2RYF7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
HCG22E2RYF7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms