Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms