Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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